การแข่งขันฟุตบอล ไทยลีกภูมิภาค ดิวิชั่น 2 ฤดูกาล 2016 แข่งขันมาแล้วครึ่งทางของเลกแรก และจะแข่งขันต่อไปจนถึงวันเสาร์-อาทิตย์ 11-12 มิถุนายน 2559 และจะทำการพักครึ่งฤดูกาลเป็นเวลา 2 สัปดาห์ ก่อนที่จะกลับมาแข่งขันในเลกที่สอง ในวันที่ 25 มิถุนายน 2559
พร้อมกันนี้ กรวีร์ ปริศนานันทกุล ประธานฝ่ายจัดการแข่งขัน ไทยลีกภูมิภาค ดิวิชั่น 2 เปิดเผยว่า ตลาดซื้อขายนักเตะช่วงครึ่งฤดูกาล จะเริ่มตั้งแต่วันที่ 18 มิถุนายน - 15 กรกฎาคม 2559 พร้อมกับ ไทยลีก 2016 นั่นเอง
สำหรับการแข่งขัน ไทยลีกภูมิภาค ดิวิชั่น 2 ฤดูกาล 2016 ทีมแชมป์ และ รองแชมป์ ของแต่ละโซน จะได้สิทธิแข่งขันรอบแชมเปี้ยนส์ลีก ส่วนลำดับสุดท้ายจะต้องตกชั้น 1 ทีม และจะมีทีมจากลีกระดับ ดิวิชั่น 3 เลื่อนขึ้นมาแข่งขัน โซนละ 1 ทีมเช่นกัน
ด้านโปรแกรมการแข่งขัน ไทยลีกภูมิภาค ดิวิชั่น 2 ฤดูกาล 2016 เลกที่ 2 จะใช้โปรแกรมเหมือน เลกแรก เรียงลำดับไปเหมือนเดิม แต่จะสลับทีมแข่งขัน เหย้า-เยือน ส่วนจะแข่งขันในวันเสาร์ หรือ วันอาทิตย์ ต้องรอโปรแกรมของ ไทยลีก 2016 และ ไทยลีกดิวิชั่น 1 ที่ใช้สนามร่วมกันในกรณีของหลายสโมสร
