การแข่งขันฟุตบอล ไทยเอฟเอคัพ 2016 รอบที่สอง (รอบ 32 ทีมสุดท้าย) หลังจากผ่านการแข่งขัน รอบแรก ไปเมื่อวันพุธ 15 มิถุนายน 2559 ที่ผ่านมา
ผลการจับสลากประกบคู่ ไทยเอฟเอคัพ 2016 รอบที่สอง (รอบ 32 ทีมสุดท้าย)
- ชลบุรี เอฟซี VS หนองบัว พิชญ เอฟซี
- ประจวบ เอฟซี VS ตราด เอฟซี
- จันทบุรี เอฟซี VS บุรีรัมย์ ยูไนเต็ด
- นครราชสีมา มาสด้า เอฟซี VS นรา ยูไนเต็ด
- สุพรรณบุรี เอฟซี VS กรุงธนบุรี เอฟซี
- อุบล ยูเอ็มที ยูไนเต็ด VS ราชบุรี มิตรผล เอฟซี
- สุโขทัย เอฟซี VS โอสถสภา เอ็ม-150 (ซุปเปอร์ พาวเวอร์ สมุทรปราการ)
- การท่าเรือ เอฟซี VS บีอีซี เทโร ศาสน
- พัทยา ยูไนเต็ด VS เอสซีจี เมืองทอง ยูไนเต็ด
- สีหมอก เอฟซี VS ระยอง เอฟซี
- เชียงราย ยูไนเต็ด VS บางกอกกล๊าส เอฟซี
- ชัยนาท ฮอร์นบิล VS บ้านบึง ยูไนเต็ด
- ศรีสะเกษ เอฟซี VS สงขลา ยูไนเต็ด
- ขอนแก่น ยูไนเต็ด VS เชียงใหม่ เอฟซี
- นนทบุรี เอฟซี VS สมุทรสาคร เอฟซี
- อาร์มี่ ยูไนเต็ด VS กระบี่ เอฟซี
ทั้งนี้ การแข่งขันฟุตบอล ไทยเอฟเอคัพ 2016 รอบที่สอง (รอบ 32 ทีมสุดท้าย) จะแข่งขันในวันพุธ 13 กรกฎาคม 2559
