วันอังคาร 12 กันยายน 2560 ฝ่ายจัดการแข่งขัน ฟุตบอล ไทยลีก 3 ได้ทำพิธี จับสลากทีมเหย้า-เยือน ของการแข่งขันเพื่อหาแชมป์ ไทยลีก 3 ประจำฤดูกาล 2017 โดยการแข่งขัน ไทยลีก 3 ฤดูกาล 2017 แบ่งการแข่งขันออกเป็น 2 โซน ได้แก่ ตอนบนของประเทศ และ ตอนล่างของประเทศ โดยแชมป์ของแต่ละโซน จะต้องมาแข่งขันกัน เพื่อหาแชมป์ประจำฤดูกาล
การจับสลาก ทีมเหย้า-เยือน ไทยลีก 3 ฤดูกาล 2017 รอบชิงชนะเลิศ สมุทรสาคร เอฟซี VS ขอนแก่น เอฟซี
การแข่งขัน ในฤดูกาลปกติ ไทยลีก 3 จะแบ่งออกเป็น 2 โซน ได้แก่ ตอนบนของประเทศ และ ตอนล่างของประเทศ โดยแชมป์ของแต่ละโซน จะต้องแข่งขันเพื่อหาตำแหน่งแชมป์ และ ทีมอันดับ 2 ของแต่ละโซน จะต้องมาแข่งขันเพลย์ออฟ เพื่อแย่งสิทธิในการเลื่อนชั้น ไปแข่งขัน ไทยลีก 2 ในฤดูกาลหน้า
แชมป์ ไทยลีก 3 โซนบนของประเทศ ได้แก่ สโมสร ขอนแก่น เอฟซี จากการแข่งขัน 25 นัด ชนะ 17 นัด เสมอ 5 นัด และ แพ้ 3 นัด มี 56 คะแนน (เหลือการแข่งขัน 1 นัด)
ด้าน แชมป์ ไทยลีก 3 โซนล่างของประเทศ ได้แก่ สโมสรฟุตบอล สมุทรสาคร เอฟซี จากการแข่งขัน 27 นัด ชนะ 20 นัด เสมอ 4 นัด และ แพ้ 3 นัด มี 64 คะแนน (เหลือการแข่งขัน 1 นัด)
สำหรับการแข่งขัน ในรอบชิงชนะเลิศ ไทยลีก 3 ฤดูกาล 2017 นัดแรก สมุทรสาคร เอฟซี จะเปิดสนาม ต้อนรับ ขอนแก่น เอฟซี ในวันอาทิตย์ 1 ตุลาคม 2560 และในนัดที่สอง ขอนแก่น เอฟซี จะพบกับ สมุทรสาคร เอฟซี ในวันเสาร์ 7 ตุลาคม 2560
ส่วนการแข่งขัน เพลย์ออฟ เพื่อหาทีมอันดับ 3 ได้สิทธิเลื่อนชั้น ของอันดับ 2 ของทั้งสองโซน นัดแรก ตรัง เอฟซี (รองแชมป์ โซนล่างของประเทศ) พบกับทีม อุดรธานี เอฟซี หรือ อยุธยา เอฟซี ในวันเสาร์ 30 กันยายน 2560 และ นัดที่สอง รองแชมป์ โซนบนของประเทศ พบกับ ตรัง เอฟซี ในวันอาทิตย์ 8 ตุลาคม 2560 ตามลำดับ
