หลังจากเมื่อวันพฤหัสบดี 3 มีนาคม 2559 ข่าวการตัดสิทธิสโมสร ทีโอที เอสซี จากการแข่งขัน ไทยลีกดิวิชั่น 1 ฤดูกาล 2016 เนื่องจากสโมสร ทีโอที เอสซี ค้างจ่ายค่าแรงนักกีฬา จำนวน 13 ราย เป็นจำนวนเงินกว่า 2.4 ล้านบาท โดยมีตัวแทน เข้าร้องเรียนกับสมาคมกีฬาฟุตบอลแห่งประเทศไทยฯ จนฝ่ายจัดการแข่งขัน ไทยลีกดิวิชั่น 1 ตัดสิทธิสโมสร ทีโอที เอสซี เพราะไม่ผ่านคลับไลเซนซิ่ง ด้านการเงิน
ล่าสุดเมื่อเช้า วันศุกร์ 4 มีนาคม 2559 สโมสร ทีโอที เอสซี ได้เดินทางมายื่นอุทธรณ์ต่อ สมยศ พุ่มพันธุ์ม่วง นายกสมาคมกีฬาฟุตบอลฯ โดยขอเจรจาชำระเงินค่าจ้างที่ค้างจ่ายจำนวน 2.4 ล้านบาท จากนั้น นายกสมาคมกีฬาฟุตบอล ได้ปรึกษากับ อนุฤทธิ์ เกิดสินธ์ชัย ประธานจัดการแข่งขัน ไทยลีกดิวิชั่น 1 เห็นว่า ควรจะให้โอกาส สโมสรฟุตบอล ทีโอที เอสซี ได้ดำเนินการตามที่ร้องขอ โดยสมาคมกีฬาฟุตบอลฯ ได้วางเงื่อนไข ให้ชำระเงินที่ค้างทั้งหมดภายในเวลา 15.00 น. ของวันศุกร์ 4 มีนาคม 2559
แต่เมื่อถึงเวลา 15.00 น. ที่สมาคมกีฬาฟุตบอลฯ ได้กำหนดไว้ ทางสโมสร ทีโอที เอสซี ยังไม่สามารถดำเนินการชำระเงินค้างจ่าย จำนวน 2.4 ล้านบาท และขอขยายเวลาออกไปอีก จนล่าสุด สมาคมกีฬาฟุตบอลฯ และฝ่ายจัดการแข่งขัน ไทยลีกดิวิชั่น 1 ฤดูกาล 2016 ตัดสินใจยืนยัน ในคำตัดสินเดิม ตามที่ประกาศ ตัดสิทธิการแข่งขัน ของสโมสร ทีโอที เอสซี ไปก่อนหน้านี้
ชนินทร์ แก่นหิรัญ รองเลขาธิการ ฝ่ายกฎหมาย สมาคมกีฬาฟุตบอลแห่งประเทศไทยฯ เปิดเผยว่า สมาคมกีฬาฟุตบอลฯ และ ฝ่ายจัดการแข่งขัน ไทยลีกดิวิชั่น 1 ให้โอกาส ทีโอที เอสซี ตามที่ขออุทธรณ์เข้ามา โดยมีทางเลือก 2 ทาง ได้แก่ ชำระเงินที่ค้างทั้งหมด หรือ ให้นักกีฬาเซ็นรับรองภายในเวลา 15.00 น. แต่เมื่อถึงเวลา ทีโอที เอสซี ยังไม่สามารถทำตามเงื่อนไขที่กำหนด พร้อมทั้งได้ติดต่อขอเลื่อนเวลาออกไปอีก
ทั้งนี้ หลังจากถูกตัดสิทธิ หากสโมสรฟุตบอล ทีโอที เอสซี ต้องการจะเข้าร่วมการแข่งขันอีกครั้ง จะต้องไปเริ่มแข่งขันในระดับ ไทยลีกภูมิภาค ดิวิชั่น 2 เหมือนกับที่ สโมสรเพื่อนตำรวจ ถูกตัดสิทธิไปก่อนหน้านี้